خالد شیخ محمد از سال ۲۰۰۳ در بازداشتگاه گوانتانامو نگهداری میشود
او پس از دستگیری در پاکستان، سه سال در زندانهای مخفی سیا تحت شکنجههای مختلف از جمله ۱۸۳ بار غرق مصنوعی (واتربوردینگ)، محرومیت از خواب و برهنهسازی اجباری قرار گرفت که شواهد پرونده را از نظر حقوقی پیچیده کرده است.
توافق لغوشده به خانوادههای قربانیان اجازه میداد از محمد سؤال بپرسند و او موظف به پاسخگویی صادقانه بود.
خانوادههای قربانیان ۱۱ سپتامبر درباره این توافق اختلافنظر داشتند، برخی محاکمه را راه عدالت و کشف حقیقت میدانستند و برخی آن را فرصتی برای پایان پروندهای دردناک تلقی میکردند.
حملات ۱۱ سپتامبر ۲۰۰۱، مرگبارترین حمله تروریستی در خاک آمریکا بود که با ربودن چهار هواپیما توسط القاعده انجام شد.
در این حملات ۱۱ که در آن هواپیماهای ربوده شده به دو ساختمان مرکز تجارت جهانی و پنتاگون برخورد کردند و تقریبا ۳۰۰۰ نفر کشته شدند.
خالد شیخ محمد از زمان دستگیری، چهره کلیدی این پرونده جنجالی بوده است.
جلسات پیش از محاکمه این پرونده بیش از یک دهه است که ادامه دارد و با سوالاتی در مورد اینکه آیا شکنجه محمد و سایر متهمان در بازداشت ایالات متحده، موجب مخدوش شدن شهادت آنها شده یا نه، پیچیدهتر شده است.
